As Divisões estabelecidas dos Órgãos e Serviços Auxiliares de Apoio Administrativo do Ministério Público do Estado do Amapá, conforme a Lei Complementar no 0047/2008, são:
Folha de Pagamento de Membros, Serviços Gerais, Tecnologia e Telecomunicação e Finanças.
Cadastro de Servidores, Controle Patrimonial, Rede de Computadores e Controle Financeiro.
Transporte, Movimentação Orçamentária, Manutenção de Veículos e Projetos e Sistemas.
Acompanhamento Funcional de Servidores, Arquitetura, Banco de Dados e Finanças.
Treinamento e Aperfeiçoamento, Controle Patrimonial, Rede de Computadores e Controle Financeiro.